La influencia alemana recogida por la Institución a fines del siglo XIX hizo presente las ventajas de contar con establecimientos de enseñanza de la doctrina de cada una de las armas. En este contexto se hizo imperiosa la necesidad de contar con una escuela que permitiera aunar criterios en la instrucción de equitación de las unidades y desarrollar en los oficiales y clases de las armas montadas los conocimientos táctico-técnicos de su especialidad.

Por otra parte, se consideró necesaria la formación de personal competente en las áreas de veterinaria y herraje y la entrega de conocimientos ecuestres a los oficiales de Artillería para el servicio del Ejercito. El decreto que dispuso su creación corresponde al N.° 1.652 de fecha 18 de noviembre de 1903, que establece la organización de la “Escuela de Aplicación de Caballería”, dependiente del Departamento de Instrucción.

El nuevo Instituto comenzó a funcionar a partir de enero del año 1904 en la avenida José Miguel Infante, casi esquina de Avenida Irarrázaval (comuna de Ñuñoa), siendo su primer Director el sargento mayor Agustín Echavarría Moreno.

De esta manera, el Instituto inició sus actividades contando en sus instalaciones con la infraestructura mínima necesaria para desarrollarlas, tanto para el alojamiento del personal como para la instrucción y naves para el ganado, correspondiente a las distintas unidades que en ese entonces conformaban la Escuela.